Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPJQ9HC77 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms