Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms