Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG6Q9BXT2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms