Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms