Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC32Q9BV29 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms