Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NICN1Q9BSH3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NICN1Q9BSH3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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