Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms