Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRBNQ96SW2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRBNQ96SW2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms