Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIN3AQ96ST3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms