Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC7Q96M83 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms