Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms