Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFHD2Q96C19 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms