Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTSSAQ969W0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms