Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RGP1Q92546 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms