Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms