Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms