Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms