Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD163Q86VB7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms