Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms