Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms