Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF550Q7Z398 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms