Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APTXQ7Z2E3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms