Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCF23Q7RTU1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms