Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms