Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms