Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms