Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms