Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM236Q5W0B7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms