Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRIP1Q5VSL9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms