Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEX3CQ5U5Q3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms