Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COLEC12Q5KU26 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms