Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD9Q5K651 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD9Q5K651 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms