Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF3Q3KNV8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms