Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPHKAPQ2M3C7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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