Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CSPP1Q1MSJ5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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