Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GEN1Q17RS7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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GEN1Q17RS7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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