Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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NDUFA9Q16795 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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