Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCSK7Q16549 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCSK7Q16549 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms