Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRR4Q16378 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms