Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDCD2Q16342 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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