Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTRK3Q16288 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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