Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC6Q16204 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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