Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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