Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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