Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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PDCD1Q15116 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDCD1Q15116 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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