Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3GAP1Q15042 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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