Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCAPHQ15003 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NCAPHQ15003 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms