Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms