Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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