Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB31Q13636 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms